MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 69189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009632	ACT	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009632	TAC	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009632	T	7	7	110	116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009632	ATT	2	6	249	254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009632	AC	3	6	358	363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009632	TG	3	6	431	436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009632	GTC	2	6	442	447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009632	ATTT	2	8	468	475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009632	TAA	2	6	508	513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009632	TTA	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009632	ATT	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009632	GT	3	6	568	573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009632	AAGA	2	8	621	628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009632	TAT	2	6	765	770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
15	NC_009632	CAA	2	6	803	808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392481
16	NC_009632	TGT	2	6	841	846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392481
17	NC_009632	TAC	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392481
18	NC_009632	GAA	2	6	881	886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
19	NC_009632	TAA	2	6	901	906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392481
20	NC_009632	ACA	2	6	929	934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392481
21	NC_009632	AAC	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392481
22	NC_009632	AG	3	6	977	982	50 %	0 %	50 %	0 %	150392481
23	NC_009632	GCA	2	6	1046	1051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392481
24	NC_009632	ATT	2	6	1093	1098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
25	NC_009632	GGTT	2	8	1111	1118	0 %	50 %	50 %	0 %	150392481
26	NC_009632	ATGC	2	8	1136	1143	25 %	25 %	25 %	25 %	150392481
27	NC_009632	TCA	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392481
28	NC_009632	ATA	2	6	1164	1169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392481
29	NC_009632	TTA	2	6	1221	1226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
30	NC_009632	TTA	2	6	1286	1291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
31	NC_009632	GAT	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392481
32	NC_009632	AAG	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
33	NC_009632	ACC	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392481
34	NC_009632	AGA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
35	NC_009632	TTG	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392481
36	NC_009632	CCA	2	6	1478	1483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392481
37	NC_009632	AGA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
38	NC_009632	GAA	3	9	1523	1531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
39	NC_009632	CCA	2	6	1544	1549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392481
40	NC_009632	TA	3	6	1562	1567	50 %	50 %	0 %	0 %	150392481
41	NC_009632	CAAAT	2	10	1569	1578	60 %	20 %	0 %	20 %	150392481
42	NC_009632	ATT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
43	NC_009632	CTG	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392481
44	NC_009632	A	6	6	1734	1739	100 %	0 %	0 %	0 %	150392481
45	NC_009632	A	7	7	1783	1789	100 %	0 %	0 %	0 %	150392481
46	NC_009632	AG	3	6	1838	1843	50 %	0 %	50 %	0 %	150392481
47	NC_009632	GAA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
48	NC_009632	TGG	2	6	1882	1887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392481
49	NC_009632	TCAT	2	8	1905	1912	25 %	50 %	0 %	25 %	150392481
50	NC_009632	A	6	6	1920	1925	100 %	0 %	0 %	0 %	150392481
51	NC_009632	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
52	NC_009632	AAG	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
53	NC_009632	TA	3	6	2031	2036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009632	TAA	3	9	2044	2052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009632	T	6	6	2059	2064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009632	TA	3	6	2072	2077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009632	AC	3	6	2131	2136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009632	CCA	2	6	2195	2200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009632	CTA	3	9	2212	2220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009632	TA	3	6	2240	2245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009632	TA	4	8	2248	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009632	TAAT	2	8	2274	2281	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
63	NC_009632	ATT	2	6	2305	2310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
64	NC_009632	TTA	2	6	2311	2316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
65	NC_009632	AAC	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392482
66	NC_009632	AGT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
67	NC_009632	TTG	2	6	2527	2532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392482
68	NC_009632	A	7	7	2540	2546	100 %	0 %	0 %	0 %	150392482
69	NC_009632	ATTA	2	8	2594	2601	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
70	NC_009632	AATTT	2	10	2617	2626	40 %	60 %	0 %	0 %	150392482
71	NC_009632	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
72	NC_009632	CAATT	2	10	2683	2692	40 %	40 %	0 %	20 %	150392482
73	NC_009632	GACT	2	8	2816	2823	25 %	25 %	25 %	25 %	150392482
74	NC_009632	AGA	2	6	2855	2860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392482
75	NC_009632	TCA	2	6	2881	2886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392482
76	NC_009632	TAAA	2	8	2911	2918	75 %	25 %	0 %	0 %	150392482
77	NC_009632	GAA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392482
78	NC_009632	TCT	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392482
79	NC_009632	TTTA	2	8	2972	2979	25 %	75 %	0 %	0 %	150392482
80	NC_009632	ATT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
81	NC_009632	ACA	2	6	3033	3038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392482
82	NC_009632	AAATT	2	10	3061	3070	60 %	40 %	0 %	0 %	150392482
83	NC_009632	TTA	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
84	NC_009632	GGT	2	6	3132	3137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392482
85	NC_009632	TTA	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
86	NC_009632	TGA	2	6	3164	3169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
87	NC_009632	GTT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392482
88	NC_009632	TCT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392482
89	NC_009632	AGA	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392482
90	NC_009632	GGT	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392482
91	NC_009632	TTCA	2	8	3260	3267	25 %	50 %	0 %	25 %	150392482
92	NC_009632	AT	3	6	3275	3280	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
93	NC_009632	GATG	2	8	3281	3288	25 %	25 %	50 %	0 %	150392482
94	NC_009632	ATG	2	6	3307	3312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
95	NC_009632	GTTGAA	2	12	3315	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
96	NC_009632	TTC	2	6	3327	3332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392482
97	NC_009632	GAC	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392482
98	NC_009632	AATT	2	8	3385	3392	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
99	NC_009632	ATAAAT	2	12	3416	3427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009632	ATTA	2	8	3441	3448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009632	T	6	6	3464	3469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009632	AAT	2	6	3476	3481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009632	AAAT	2	8	3498	3505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009632	TAA	2	6	3571	3576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009632	TTTAAA	2	12	3593	3604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009632	A	6	6	3661	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009632	A	6	6	3687	3692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009632	AATT	2	8	3697	3704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009632	A	7	7	3753	3759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009632	AT	3	6	3766	3771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009632	AC	3	6	3777	3782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009632	ATT	2	6	3797	3802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009632	AAG	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392483
114	NC_009632	GTA	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392483
115	NC_009632	ATT	2	6	3866	3871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392483
116	NC_009632	TGG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392483
117	NC_009632	ATTA	2	8	3916	3923	50 %	50 %	0 %	0 %	150392483
118	NC_009632	TTCT	2	8	4006	4013	0 %	75 %	0 %	25 %	150392483
119	NC_009632	TCAT	2	8	4017	4024	25 %	50 %	0 %	25 %	150392483
120	NC_009632	ATG	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392484
121	NC_009632	A	6	6	4300	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	150392484
122	NC_009632	GTC	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392484
123	NC_009632	AT	3	6	4353	4358	50 %	50 %	0 %	0 %	150392484
124	NC_009632	AGA	2	6	4389	4394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392484
125	NC_009632	CTC	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150392484
126	NC_009632	GAC	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392484
127	NC_009632	CTG	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392484
128	NC_009632	AAT	2	6	4516	4521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392484
129	NC_009632	A	7	7	4547	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	150392484
130	NC_009632	CAG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392484
131	NC_009632	AAG	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392484
132	NC_009632	ATT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392484
133	NC_009632	GAA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392484
134	NC_009632	ATA	2	6	4784	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392484
135	NC_009632	GAT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392484
136	NC_009632	TTA	3	9	4972	4980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392484
137	NC_009632	GAT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392484
138	NC_009632	TTA	2	6	5023	5028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392484
139	NC_009632	ACA	2	6	5183	5188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392485
140	NC_009632	GTAT	2	8	5255	5262	25 %	50 %	25 %	0 %	150392485
141	NC_009632	AG	4	8	5277	5284	50 %	0 %	50 %	0 %	150392485
142	NC_009632	ATA	2	6	5315	5320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392485
143	NC_009632	GTT	2	6	5362	5367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392485
144	NC_009632	A	6	6	5432	5437	100 %	0 %	0 %	0 %	150392485
145	NC_009632	TGG	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392485
146	NC_009632	CGG	2	6	5493	5498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150392485
147	NC_009632	TGG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392485
148	NC_009632	TCA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392485
149	NC_009632	TA	3	6	5598	5603	50 %	50 %	0 %	0 %	150392485
150	NC_009632	TCA	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392485
151	NC_009632	A	6	6	5617	5622	100 %	0 %	0 %	0 %	150392485
152	NC_009632	AAG	2	6	5645	5650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392485
153	NC_009632	CAG	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392485
154	NC_009632	AG	3	6	5755	5760	50 %	0 %	50 %	0 %	150392485
155	NC_009632	TGA	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392485
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158	NC_009632	TCA	2	6	5919	5924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392485
159	NC_009632	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392485
160	NC_009632	GGT	2	6	6022	6027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392485
161	NC_009632	AGA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392485
162	NC_009632	TATC	2	8	6158	6165	25 %	50 %	0 %	25 %	150392485
163	NC_009632	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392485
164	NC_009632	TAT	2	6	6315	6320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392485
165	NC_009632	GGC	2	6	6321	6326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150392485
166	NC_009632	TGC	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392485
167	NC_009632	A	6	6	6346	6351	100 %	0 %	0 %	0 %	150392485
168	NC_009632	CGT	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392485
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170	NC_009632	G	6	6	6475	6480	0 %	0 %	100 %	0 %	150392485
171	NC_009632	TAGA	2	8	6563	6570	50 %	25 %	25 %	0 %	150392485
172	NC_009632	TGGA	2	8	6689	6696	25 %	25 %	50 %	0 %	150392485
173	NC_009632	TTA	2	6	6715	6720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392485
174	NC_009632	TTC	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392485
175	NC_009632	TAT	2	6	6817	6822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392485
176	NC_009632	TGAAT	2	10	6858	6867	40 %	40 %	20 %	0 %	150392485
177	NC_009632	AATG	2	8	6912	6919	50 %	25 %	25 %	0 %	150392485
178	NC_009632	ACA	2	6	6937	6942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392485
179	NC_009632	AGA	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392485
180	NC_009632	TGAAC	2	10	7099	7108	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
181	NC_009632	AGG	2	6	7115	7120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009632	TCAA	2	8	7143	7150	50 %	25 %	0 %	25 %	150392486
183	NC_009632	TCG	2	6	7266	7271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392486
184	NC_009632	A	6	6	7321	7326	100 %	0 %	0 %	0 %	150392486
185	NC_009632	GTTATC	2	12	7421	7432	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392486
186	NC_009632	TTG	2	6	7436	7441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392486
187	NC_009632	ATGG	2	8	7465	7472	25 %	25 %	50 %	0 %	150392486
188	NC_009632	GCA	3	9	7480	7488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392486
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192	NC_009632	GGTA	2	8	7656	7663	25 %	25 %	50 %	0 %	150392486
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198	NC_009632	GAA	2	6	7876	7881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392486
199	NC_009632	TTG	2	6	7904	7909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392486
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201	NC_009632	TCGT	2	8	7967	7974	0 %	50 %	25 %	25 %	150392486
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211	NC_009632	CAGATA	2	12	8330	8341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150392486
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213	NC_009632	CAAGCT	2	12	8389	8400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150392486
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219	NC_009632	TGA	2	6	8571	8576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392486
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241	NC_009632	GAA	2	6	9415	9420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392486
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250	NC_009632	AGA	2	6	9699	9704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392486
251	NC_009632	ATG	2	6	9707	9712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392486
252	NC_009632	GAA	2	6	9757	9762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392486
253	NC_009632	ACA	2	6	9768	9773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392486
254	NC_009632	ATC	2	6	9774	9779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392486
255	NC_009632	AGATGA	2	12	9780	9791	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392486
256	NC_009632	AAT	2	6	9794	9799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392486
257	NC_009632	A	7	7	9800	9806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009632	TGG	2	6	9937	9942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392487
259	NC_009632	CATA	2	8	9948	9955	50 %	25 %	0 %	25 %	150392487
260	NC_009632	CTT	2	6	10011	10016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392487
261	NC_009632	ACC	2	6	10075	10080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392487
262	NC_009632	T	6	6	10150	10155	0 %	100 %	0 %	0 %	150392487
263	NC_009632	ACA	2	6	10160	10165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392487
264	NC_009632	ATCGC	2	10	10316	10325	20 %	20 %	20 %	40 %	150392487
265	NC_009632	GTA	2	6	10362	10367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392487
266	NC_009632	ATT	2	6	10381	10386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392487
267	NC_009632	GTCA	2	8	10429	10436	25 %	25 %	25 %	25 %	150392487
268	NC_009632	TTG	2	6	10521	10526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392487
269	NC_009632	CAC	2	6	10593	10598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392487
270	NC_009632	CCA	2	6	10613	10618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392487
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272	NC_009632	TCT	2	6	10655	10660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392487
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